Kinnex全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用 MAS-seq 方法，將 cDNA 分子串聯(lián)成長(zhǎng)片段，串聯(lián)分子使用PacBio Revio平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序，產(chǎn)生的 HiFi reads 經(jīng)過(guò)生物信息學(xué)拆分，即可還原原始 cDNA 序列。全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，RNA分子無(wú)需打斷，測(cè)序可直接獲得完整序列。通過(guò)全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能夠更準(zhǔn)確地得到轉(zhuǎn)錄本信息，可鑒定更多可變剪接位點(diǎn)、新基因和新的異構(gòu)體、融合基因等。
| 測(cè)序深度 | 數(shù)據(jù)表現(xiàn) | 研究目標(biāo) |
| 5M reads | 基因和isofroms的檢出率高達(dá)80% | 鑒定高表達(dá)isofroms和基因、完善物種基因組注釋 |
| 10M reads | 發(fā)現(xiàn)更多低/中/高表達(dá)基因和復(fù)雜isofroms | 檢測(cè)中/低表達(dá)基因和復(fù)雜isofroms |
| 送樣要求 | |
| 樣本類型 | 溶液澄清， 無(wú) DNA 污染和蛋白等雜質(zhì)污染的 total RNA |
| 樣品需求量 | ≥0.6 μg |
| 樣品濃度 | 40 ng/μl |
| 樣品完整性 | RIN≥7 |
| 注意事項(xiàng) | RNA必須無(wú)顏色、不粘稠、無(wú)顆粒物、未暴露于高溫、未暴露于高低 pH，未反復(fù) 凍融 |
