ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing）是利用高通量測(cè)序檢測(cè)轉(zhuǎn)座酶易接近的染色質(zhì)的一門技術(shù)。ATAC-seq 只需要很少的細(xì)胞就能鑒定基因組中所有活躍的調(diào)控序列。在 ATAC-seq 技術(shù)中，利用轉(zhuǎn)座酶Tn5特異性識(shí)別并結(jié)合到開(kāi)放染色質(zhì)區(qū)域的裸露DNA上，切割DNA的同時(shí)插入測(cè)序接頭，通過(guò)擴(kuò)增形成完整文庫(kù)，上機(jī)測(cè)序、分析鑒定染色質(zhì)開(kāi)放區(qū)域。
| 推薦數(shù)據(jù)量 | 測(cè)序策略 | 推薦測(cè)序平臺(tái) | 細(xì)胞活性 |
動(dòng)物 50M Reads，植物 100 M Reads | PE150 | 二代測(cè)序平臺(tái) | ≥80% |
| 產(chǎn)品類型 | 樣品要求 | |
| ATAC-seq | 樣品類型 | 動(dòng)物來(lái)源的新鮮細(xì)胞、凍存細(xì)胞或凍存組織 |
| 樣品需求量 | 每個(gè)反應(yīng)需細(xì)胞5-10萬(wàn)個(gè)，組織約50 mg | |
| 樣品活性 | 制備為細(xì)胞懸液時(shí)，活性在80%以上 | |
| 樣品純度 | 需要避免外源污染 | |
| 樣本預(yù)處理 | 預(yù)處理需參考乙方提供的詳細(xì)資料 | |
